DNA de alta qualidade isolado a partir do córtex de <i>Euterpe edulis</i> Mart. (Arecaceae)

Autores

DOI:

https://doi.org/10.5902/1980509824130

Palavras-chave:

Palmiteiro juçara, Estipe, Isolamento de DNA, Microssatélites

Resumo

Euterpe edulis (palmiteiro juçara) é uma arbórea de porte alto que ocorre naturalmente em florestas da Mata Atlântica e Cerrado. Por estas características é difícil coletar folhas jovens, sadias e frescas para obtenção de DNA genômico de boa qualidade para a espécie, necessário para estudos de biologia molecular. Visando facilitar coletas a campo de material biológico, neste estudo foi proposta uma nova metodologia de extração a partir de tecidos vegetais do córtex. Foram comparadas extrações e análises realizadas com DNA obtido de folhas jovens oriundas de mudas e de tecido do córtex de plantas adultas. A integridade do DNA obtido foi confirmada por eletroforese, revelando DNA genômico com pouca degradação e a qualidade da purificação foi verificada pelos critérios de razões de absorbâncias de 260/280 nm e 260/230 nm, apresentando padrão similar nos dois tipos de tecidos avaliados. As concentrações de DNA em folha variaram de 81,9 a 310,1 ng/μL, e no córtex, de 105,2 a 404,8 ng/μL. A confirmação da qualidade do DNA obtido foi determinada por amplificação de microssatélites onde os produtos apresentaram bandas definidas para os dois materiais vegetais. Assim o DNA genômico extraído a partir do córtex de Euterpe edulis, constitui um tecido vegetal adicional para obtenção de DNA genômico de igual qualidade, quantidade e integridade que o obtido de folhas, com a vantagem da coleta ser facilitada a campo.

Downloads

Não há dados estatísticos.

Biografia do Autor

Marina Santos Carvalho, Universidade Federal do Espírito Santo, Vitória, ES

Bióloga, MSc., Doutoranda do Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento, Centro de Ciências Agrárias e Engenharias, Universidade Federal do Espírito Santo.

Marcia Flores da Silva Ferreira, Universidade Federal do Espírito Santo, Vitória, ES

Bióloga, Dra., Professora do Departamento de Biologia, Centro de Ciências Humanas e Naturais, Universidade Federal do Espírito Santo.

Adésio Ferreira, Universidade Federal do Espírito Santo, Vitória, ES

Agrônomo, Dr., Professor de Produção Vegetal, Centro de Ciências Agrárias e Engenharias, Universidade Federal do Espírito Santo.

Luina Ribeiro Noia, Universidade Federal do Espírito Santo, Vitória, ES

Engenheira Agrônoma, MSc., Centro de Ciências Agrárias e Engenharias, Universidade Federal do Espírito Santo.

Referências

AHMED, I. et al. High-quality plant DNA extraction for PCR: an easy approach. Journal of Applied Genetics,Poznan, v. 50, n. 2, p. 105-107, 2009.

BERNARDS, M. A. Demystifying suberin. Canadian Journal of Botany, Ottawa, v. 80, n. 3, p. 227-240, 2002.

CINGILLI, H.; AKÇIN, A. High quality DNA isolation method for chickpea genotypes. Turkish Journal of Biology, Ankara, v. 29, n. 1, p. 1-5, 2005.

DANELLI, M. F.; FISCH, S. T. V.; VIEIRA, S. A. Análise da estrutura e biomassa florestal de áreas de colheita de frutos de juçara (Euterpeedulis Mart.) no litoral norte e serra do ar-SP. Ciência Florestal, Santa Maria, v. 26, n. 3, 2016.

DOYLE, J. J.; DOYLE, J. L. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, Rockville, v. 12, n. 27, p. 13-15, 1990.

FERREIRA, M. E.; GRATTAPAGLIA, D. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética.3. ed. Brasília: EMBRAPA; CENARGEN, 1998. 220 p.

FINKELDEY, R.; LEINEMANN, L.; GAILING, O. Molecular genetic tools to infer the origin of forest plants and wood. Applied Microbiology and Biotechnology, Berlin, v. 85, n. 5, p. 1251-1258, 2010.

GAIOTTO, F. A.; BRONDANI, R. P. V.; GRATTAPAGLIA, D. Microsatellite markers for heart of palm – Euterpe edulis and E. oleracea Mart. (Arecaceae). Molecular Ecology Notes, Oxford, v. 1, n. 1/2, p.

CHASE, M. W.; HILLS, H. H. Silica gel: an ideal material for feld preservation of leaf samples for DNA studies. Taxon, Viena, v. 40, n. 2, p. 215-220, 1991.

GENINI, J.; GALETTI, M.; MORELLATO, L. P. C. Fruiting phenology of palms and trees in an Atlantic rainforest land-bridge island. Flora, Jena, v. 204, n. 2, p. 131-145, 2009.

GLASEL, J. A. Validity of nucleic acid purities monitored by 260 nm/280 nm absorbance ratios. BioTechniques,New York, v. 18, n. 1, p. 62-63, 1995.

INÁCIO, M. R. C. et al. Total anthocyanin content determination in intact açaí (Euterpeoleracea Mart.) and palmiteiro-juçara (Euterpe edulis Mart.) fruit using near infrared spectroscopy (NIR) and multivariate calibration. Food Chemistry,Barking, v. 136, n. 3, p. 1160-1164, 2013.

JURA-MORAWIEC, J.; TULIK, M.; IQBAL, M. Lateral meristems responsible for secondary growth of the monocotyledons: a survey of the state of the art. Botanical Review, Bronx, v. 81, n. 2, p. 150-161, 2015.

KALIA, R. K. et al. Microsatellite markers: an overview of the recent progress in plants. Euphytica, Wageningen, v. 177, n. 3, p. 309-334, 2011.

KARACA, M. et al. Coisolation of genomic and organelle DNAs from 15 genera and 31 species of plants. Analytical Biochemistry, New York, v. 343, p. 353-355, 2005.

LIMA, L. S. H. Crescimento de mudas de Euterpe edulis Martius em resposta a diferentes doses de fósforo. Ciência Florestal, Santa Maria, v. 18, n. 4, p. 461-470, 2008.

MANCHESTER, K. A. Use of UV methods for measurement of protein and nucleic acid concentrations. BioTechniques, New York, v. 20, n. 6, p. 968-970, 1996.

OUBORG, J. et al. Conservation genetics in transition to conservation genomics. Trends in Genetics, Cambridge, v. 26, n. 4, p. 177-187, 2010.

PASAKINSKIENĖ, I.; PASAKINSKIENĖ, V. Floral meristems as a source of enhanced yield and quality of DNA in grasses. Plant Cell Reports, Berlin, v. 18, n. 6, p. 490-492, 1999.

REIS, A.; KAGEYAMA, P. Y. Dispersão de sementes do palmiteiro (Euterpe edulis Martius – Palmae). Sellowia: Anais Botánicos do HBR, Itajaí, v. 49, n. 49-52, p. 60-92, 2000.

SHIMIZU, M. M. et al. Enzyme characterisation, isolation and cDNA cloning of polyphenol oxidase in the hearts of palm of three commercially important species. Plant Physiology and Biochemistry, Paris, v. 49, n. 9, p. 970-977, 2011.

SINGH, V.; KUMAR, V. An optimised method of DNA isolation from highly mucilage rich okra (Abelmoschus esculentus L.) for PCR analysis. Pelagia Research Library,Udaipur, v. 3, p. 1809-1813, 2012.

STEFFAN, R. J. et al. Recovery of DNA from soils and sediments. Applied and Environmental Microbiology, Washington, v. 54, n. 12, p. 2908-2915, 1988.

TOMLINSON, P. B.; HORN, J. W.; FISHER, J. B.Anatomy of palms (Arecaceae – Palmae). New York: Oxford University Press, 2011.

WEISING, K. et al. DNA fngerprinting in plants: principles, methods, and applications. [S.l.]: CRC press, 2005. 444 p.

Downloads

Publicado

04-04-2019

Como Citar

Carvalho, M. S., Ferreira, M. F. da S., Ferreira, A., & Noia, L. R. (2019). DNA de alta qualidade isolado a partir do córtex de <i>Euterpe edulis</i> Mart. (Arecaceae). Ciência Florestal, 29(1), 396–402. https://doi.org/10.5902/1980509824130

Edição

Seção

Nota Técnica

Artigos mais lidos pelo mesmo(s) autor(es)